大家好,如果您还对dimensionality不太了解,没有关系,今天就由本站为大家分享dimensionality的知识,包括peak统计学中的意义的问题都会给大家分析到,还望可以解决大家的问题,下面我们就开始吧!
peak统计学中的意义
生命科学数据挖掘与分析及其算法研究
Peakcalling不一定是针对ATAC-seq,只要数据形式形如bed或bam等genometrack文件。稍微处理一下就可以用专业的工具进行。
峰的意义根据你的现实实验而定,比如,在ATAC中,峰实际上是你抓到的通常来说在特定实验条件下开放性比较高的序列片段(insertfragment);就形式而言,峰指的是序列中击中数/分值显著高于其他部分的片段。这个显著性指的一般是统计学意义上的,具体依据你使用的程序工具所应用的数学模型而定,可以用p值或者q值来衡量,和其他生物学实验一样,这个值越低、显著性越高、越可能是你要找的序列片段、在genomeviewer里面长得越像是个峰,thenyoucancallitapeak.
从功能上看,可以把peakcalling看成一种对高维基因组数据的数据降维(dimensionalityreduction)或特征选取(featureselection)。比如人的基因组有3G个碱基,相当于3G维的特征,通过特定的实验把感兴趣的碱基通过这种方式筛选出来,由这些碱基重组的特征就可以回答一些生物学问题。当然,把峰本身当作一种模态的特征也是可以的。
mfdll是什么
它是一个Windows操作系统中的动态链接库文件,它提供了多媒体框架(MicrosoftMediaFoundation)的API接口,用于管理音频、视频以及音视频的捕捉、编码、解码、渲染等处理能力,这些处理能力可以被应用程序所调用。
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